Các nghiên cứu lai ghép DNA-DNA gợi ý rằng 2 nhóm cú muỗi mỏ quặp có thể không có quan hệ họ hàng gần tới mức như người ta nghĩ trước đây, và các loài châu Á có thể tách ra thành họ riêng gọi là Batrachostomidae.[2]

Mặc dù theo truyền thống thì cú muỗi mỏ quặp được xếp trong bộ Caprimulgiformes, nhưng một số nghiên cứu sau này nghi vấn về điều này,[3] và chúng có thể đủ khác biệt để xếp trong bộ của chính chúng là Podargiformes, như Gregory Mathews đề xuất năm 1918.[4][5]